En helsepersonell utfører en COVID-vattpinneprøve på en pasient. Det er noen grunner til at en RT-PCR-test kan føre til falskt positivt. Shutterstock

To COVID-19 tilfeller som tidligere var knyttet til Melbournes nåværende utbrudd har nå vært omklassifisert som falske positive.

De er ikke lenger inkludert i Victorias offisielle antall saker, mens en rekke eksponeringssteder knyttet til disse sakene er fjernet.

Hoved- og "gullstandard" -testen for å oppdage SARS-CoV-2, viruset som forårsaker COVID-19, er testen for omvendt transkriptase-polymerasekjedereaksjon (RT-PCR).

RT-PCR-testen er svært spesifikk. Det vil si at hvis noen virkelig ikke har infeksjonen, er det stor sannsynlighet for at testen vil komme negativ ut. Testen er også svært sensitiv. Så hvis noen virkelig er smittet med viruset, er det stor sannsynlighet for at testen kommer tilbake positivt.


innerself abonnere grafikk


Men selv om testen er svært spesifikk, gir det fortsatt en liten sjanse for at noen som ikke har infeksjonen, gir et positivt testresultat. Dette er hva som menes med en "falsk positiv".

For det første, hvordan fungerer RT-PCR-testen?

Selv om de fleste i COVID-alderen har hørt om PCR-testen, hvordan det fungerer er forståelig nok litt av et mysterium.

Kort sagt, etter at en vattpinne er tatt fra nese og svelg, brukes kjemikalier for å trekke ut RNA (ribunokleinsyre, en type genetisk materiale) fra prøven. Dette omfatter en persons vanlige RNA og RNA fra SARS-CoV-2-viruset, hvis det er tilstede.

Dette RNA blir deretter omdannet til deoksyribonukleinsyre (DNA) - dette er hva "revers transkriptase" bit betyr. For å oppdage viruset blir de små segmentene av DNA forsterket. Ved hjelp av noe spesielt fluorescerende fargestoff identifiseres en prøve som positiv eller negativ basert på lysstyrken til fluorescensen etter 35 eller flere sykluser av amplifikasjon.

Hva forårsaker falske positive resultater?

De hovedårsaker for falske positive resultater er laboratoriefeil og reaksjon utenfor mål (det vil si testen som kryssreagerer med noe som ikke er SARS-CoV-2).

Laboratoriefeil inkluderer skrivefeil, testing av feil prøve, krysskontaminering fra andres positive prøve eller problemer med reagensene som brukes (som kjemikalier, enzymer og fargestoffer). Noen som har hatt COVID-19 og gjenopprettet, kan også vise et falskt positivt resultat.

Hvor vanlig er falske positive resultater?

For å forstå hvor ofte falske positive oppstår, ser vi på den falske positive frekvensen: andelen testede som ikke har infeksjonen, men returnerer en positiv test.

Forfatterne av en nylig preprint (et papir som ennå ikke er fagfellevurdert eller uavhengig verifisert av andre forskere) foretok en gjennomgang av bevisene på falske positive priser for RT-PCR-testen som ble brukt til å oppdage SARS-CoV-2.

De kombinerte resultatene av flere studier (noen så på PCR-testing for SARS-CoV-2 spesifikt, og noen så på PCR-testing for andre RNA-virus). De fant falske positive priser på 0-16.7%, med 50% av studiene på 0.8-4.0%.

De falske positive frekvensene i den systematiske gjennomgangen var hovedsakelig basert på kvalitetssikringstesting i laboratorier. Det er sannsynlig at nøyaktigheten i dårlige situasjoner er dårligere enn i laboratoriestudiene.

A systematisk gjennomgang ser på falske negative priser i RT-PCR-testing for SARS-CoV-2 fant falske negative priser var 1.8-58%. De påpeker imidlertid at mange av studiene var av dårlig kvalitet, og disse funnene er basert på bevis av lav kvalitet.

Ingen test er perfekt

La oss for eksempel si at den virkelige falske positive frekvensen er 4% for SARS-CoV-2 RT-PCR-testing.

For hver 100,000 mennesker som tester negativt og virkelig ikke har infeksjonen, forventer vi å ha 4,000 falske positive. Problemet er at vi for de fleste av disse aldri vet om dem. Personen som testet positivt blir bedt om å karantene, og alle antar at de hadde asymptomatisk sykdom.

Dette blir også forvirret av at den falske positive frekvensen er avhengig av sykdommens underliggende forekomst. Med svært lav forekomst som vi ser i Australia, kan antall falske positive ende opp med å bli mye høyere enn det faktiske antall positive, noe som kalles falskt positivt paradoks.

På grunn av arten av Victorias nåværende utbrudd, er myndighetene sannsynligvis ekstra påpasselige med testresultater, noe som potensielt gjør det mer sannsynlig at falske positive blir plukket opp. De Den viktorianske regjeringen sa:

Etter analyse av et ekspertanmeldelsespanel, og omprøving gjennom det viktorianske referanselaboratoriet for smittsomme sykdommer, er to tilfeller knyttet til dette utbruddet blitt erklært falske positive.

Dette gjør det ikke klart om de to personene ble testet på nytt, eller bare prøvene ble testet på nytt.

Uansett er det uheldig å ha to falske positive. Men gitt det store antallet mennesker som testes hver dag i Victoria for øyeblikket, og det faktum at vi vet at falske positive vil oppstå, er det ikke uventet.

De bredere implikasjonene

For et individ som mottok et falskt positivt testresultat, ville de bli tvunget til å gå i karantene når det ikke var behov for det. Å bli fortalt at du har en potensielt dødelig sykdom er veldig belastende, spesielt for eldre mennesker eller de som er i fare på grunn av andre helsemessige forhold. De ville trolig også være bekymret for å smitte andre familiemedlemmer, og kunne miste arbeid mens de var i karantene.

Spesielt gitte myndigheter pekte først på disse to sakene som eksempler overføring av viruset gjennom "flyktig" kontakt, har mange mennesker uten tvil lurt på om Victoria kanskje ikke er i låsing uten disse tilfellene. Dette er bare formodninger, og vi kan egentlig ikke vite den ene eller den andre måten.

Falske negative resultater er helt klart veldig bekymrende, da vi ikke vil at smittsomme mennesker vandrer rundt i samfunnet. Men falske positive kan også være problematiske.

Om forfatteren

Adrian Esterman, professor i biostatistikk og epidemiologi, University of South Australia

books_disease

Denne artikkelen opprinnelig dukket opp på Den Conversation