En genomisk undersøkelse av soppene som lever på huden vår, gir et rammeverk for å forstå hvordan disse mikrober bidrar til hudens helse og sykdom.
Komplekse samfunn av mikrober lever på overflaten av kroppene våre. Disse sopp, bakterier og virus er kollektivt kjent som hudmikrobiomet. Et team fra NIHs National Human Genome Research Institute (NHGRI) og National Cancer Institute (NCI) har tidligere brukt genomiske teknikker for å studere hudbakterier. De fant forskjellige bakterielle lokalsamfunn som varierte mellom mennesker og hudområder. I deres nye studie brukte teamet en lignende genomisk tilnærming for å få bedre forståelse av soppene som lever på huden vår.
Svampe inkluderer molds, sopp og gjær som brukes til å gjære brød og øl. Disse mikroberene har vært assosiert med mange hudsykdommer og -betingelser, inkludert idrettsfot, eksem, flass og tånegelinfeksjoner. Svamphudinfeksjoner påvirker en estimert 29 millioner mennesker landsomfattende. Men sopp kan være sakte og vanskelig å vokse i laboratorier, noe som gjør svampinfeksjoner vanskelig å identifisere og behandle.
I mai 22, 2013, samler forskerne prøver på 14 kroppssider fra 10 friske voksne. De fokuserte på et fragment av DNA som deles av alle sopp-intervenerer internt transkribert spacer 1 (ITS1) av ribosomal RNA, som kan brukes til å klassifisere sopp på slektsstaten med større enn 97% nøyaktighet.
Ved å generere mer enn 5 millioner ITS1-sekvenser fra prøvene, var laget i stand til å identifisere mer enn 80 genus-nivå sopptyper som lever på menneskelig hud. I kontrast kunne tradisjonelle dyrkningsmetoder bare identifisere 18-typer. ble funnet på alle hudområder. var den fremherskende typen på 11 på 14-stedene, inkludert bak ørene, i neseborene, på ryggen og på armene.
Teamet fant at hælene, som ikke viser omfattende bakteriell mangfold, var det mest komplekse stedet for sopp, med omtrent 80-typer representert. Tånebaner, med om 60-typer og tånegler, med 40, hadde de neste høyeste nivåene av soppdiversitet. Hender og armer, som har et stort mangfold av bakterier, hadde relativt få typer sopp. Svampemiljøer på kjernekroppen var ganske stabile over tid, med liten forandring når de ble testet opp til 3 måneder fra hverandre. I motsetning til dette, svamp på føttene endret seg betydelig over 3 måneder, noe som gjenspeiler mer miljøpåvirkning.
Svampemiljøene på menneskekroppen er komplekse og stedsspesifikke, sier medforfatter Dr. Heidi Kong of NCI. Ved å få en mer fullstendig bevissthet om sopp- og bakterielle økosystemer, kan vi bedre adressere tilknyttede hudsykdommer, inkludert soppinfeksjoner, som kan relateres til kreftbehandling.
Dataene fra studien gir oss en grunnlinje om normale personer som vi aldri hadde før, sier medforfatter Dr. Julie Segre fra NHGRI. Bunnlinjen er at føttene dine er tynt med soppdiversitet, så bruk dine flip-flops i garderober hvis du ikke vil blande fotsvampene med andres svampe.
